陕西中医药大学第二附属医院占地面积350亩，编制床位1656张，是国家三级甲等中西医结合医院、全国重点中西医结合医院、国家推拿专业区域中医诊疗中心（培育）、中医住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构、陕西省博士后创新基地、陕西省心血管科诊疗中心。2023年3月获批国家中西医协同“旗舰”医院试点项目建设单位。
医院始建于1973年，2015年更名为“陕西中医药大学第二附属医院”，被国家级新区西咸新区管委会批准为“西咸新区中心医院”。医院先后荣获“国家卫生部爱婴医院”“陕西省卫生行业文明示范单位”“陕西省卫生系统先进集体”等称号。医院拥有秦都院区、西咸院区，涵盖临床科室64个、医技科室8个。
医院现有职工2379人，其中医师782人，高级职称276人、硕博士561人，硕士研究生导师167人，拥有全国中医临床特色技术传承人才1人，全国中药特色技术传承人才2人，全国中医药创新骨干人才1人，国家中医药管理局中医临床优秀人才1人，陕西省特支计划人才1人。
现有重点专学科建设项目30个，其中国家临床重点专科（中医专业）1个；国家中医药管理局“十二五”重点学科2个、重点专科3个；陕西省中医药管理局重点学科2个、重点专科9个。开设名老中医工作室17个，国医大师张学文教授、全国老中医药专家学术经验继承指导老师殷克敬教授等一批全国著名中医药专家长期坐诊、查房和带教。
科研实力日渐雄厚。医院建立了设施完备的中心实验室及国家药物临床试验机构。获批国家中医心血管病临床医学研究分中心、陕西省中医药循证中心、陕西省中医药真实世界临床研究分中心2个、陕西省甲状腺疾病临床医学研究分中心、陕西省遗传病（优生与遗传）临床医学研究分中心、陕西省中医药管理局肿瘤经方本源剂量重点研究室。近3年来，医院共承担各级科研项目185项，其中国家自然科学基金4项；陕西省科技计划24项。获授权专利65项。获得省部级科技奖励3项。主编参编著作42部。发表学术论文832篇。
作为大学附属医院，教育教学全面发展。医院是国家中医住院医师规范化培训基地。2017年，临床医学专业被列为省级一流专业建设项目，2019年入选教育部“省级一流本科专业建设点”，2020年顺利通过教育部临床医学专业认证。建有教学区及医学模拟中心，总建筑面积约3400平方米，设备总值达2400余万元。培养的临床医学专业学生于2021年荣获西南西北分赛区特等奖及全国总决赛铜奖。医院是省内唯一一所国家中医住培教学门诊试点单位。
“十四五”期间，医院将秉承“为人民服务”的宗旨，坚持“强内涵、显特色、铸品牌”的发展战略，以建设国家中西医协同“旗舰”医院为契机，将医院建设成为国内综合能力过硬，中西医结合优势明显，特色突出，服务水平一流，集医、教、研、健康管理与文化传承为一体的大学附属医院、区域诊疗中心，为“健康陕西”和“健康中国”做出更大贡献。
